Lambang Sekolah Tinggi terdiri dari unsur-unsur yang memiliki pengertian sebagai berikut :
- Warna putih melambangkan kesucian;
- Warna hitam melambangkan keteguhan;
- Warna kuning emas melambangkan keunggulan;
- Warna merah melambangkan daya cipta karsa manusia;
- Lima sudut keluar melambangkan Pancasila, sedangkan lima sudut kedalam melambangkan Panca Sradha;
- Cupu melambangkan ilmu pengetahuan bisa menembus bumi dan langit;
- Buku melambangkan proses peningkatan dan pengembangan IPTEK;
- Genta melambangkan suara kesucian agar manusia selalu bakti kepada Tuhan;
- Sayap melambangkan manusia harus selalu berkembang pengetahuannya;
- Pita melambangkan ikatan kebersamaan; dan
- Tulisan STAHN Mpu Kuturan Singaraja berwarna hitam di tengah-tengah pita melambangkan keteguhan jati diri STAHN Mpu Kuturan Singaraja.